- a -

• absm() : atomic
• accumulation_tree_split() : TMBad
• ADFun_retaping() : TMBad
• aggregate() : TMBad
• all_allow_remap() : TMBad
• asSparseMatrix() : tmbutils
• asSparseVector() : tmbutils

- b -

• bessel_i_10() : atomic
• bessel_k_10() : atomic

- c -

• concat() : tmbutils
• contiguousBlock() : TMBad

- d -

• D_incpl_gamma_shape() : atomic
• D_lgamma() : atomic
• discrLyap() : tmbutils
• dnorm() : vectorize

- e -

• expm() : atomic

- f -

• factor() : radix
• fft() : atomic
• find_op_by_name() : TMBad
• first_occurance() : radix
• forceContiguous() : TMBad

- g -

• get_accumulation_tree() : TMBad
• get_glob() : TMBad
• getContiguous() : TMBad
• GMRF() : density
• gradient() : autodiff

- h -

• hessian() : autodiff

- i -

• integrate() : gauss_kronrod , romberg , TMBad
• inv_incpl_gamma() : atomic
• invertSparseMatrix() : tmbutils
• invpd() : atomic
• invperm() : TMBad
• isContiguous() : TMBad
• isStructuralZero() : tmbutils

- j -

• jacobian() : autodiff

- k -

• kronecker() : tmbutils

- l -

• Laplace() : newton
• lmatch() : TMBad
• logdet() : atomic

- m -

• make_space_inplace() : TMBad
• match() : TMBad
• matinv() : atomic
• matinvpd() : atomic
• matmul() : atomic , TMBad
• mvIntegrate() : gauss_kronrod , TMBad
• MVNORM() : density

- n -

• Newton() : newton

- o -

• operator<() : TMBad
• order() : TMBad

- p -

• pack() : TMBad
• pnorm1() : atomic
• ppois() : atomic
• prod_int() : TMBad

- q -

• Q_spde() : R_inla
• qnorm1() : atomic

- r -

• remap_identical_sub_expressions() : TMBad
• reorder_depth_first() : TMBad
• reorder_graph() : TMBad
• reorder_sub_expressions() : TMBad
• reorder_temporaries() : TMBad
• reverse_boundary() : TMBad

- s -

• SEPARABLE() : density
• sort_inplace() : TMBad
• sort_unique_inplace() : TMBad
• split_period() : TMBad
• sqrtm() : atomic
• subset() : TMBad
• substitute() : TMBad

- t -

• Tag() : newton

- u -

• unpack() : TMBad
• UNSTRUCTURED_CORR() : density

- v -

• value() : TMBad
• VECSCALE() : density

- w -

• which() : TMBad